关于定量生物学研究所

在过去的15-20年里，实验室计算机的能力和复杂性不断增强，这使得许多科学学科能够将正式的数学分析和计算机建模技术纳入他们的方法中。与此同时，数学家、物理学家、计算机科学家和工程师对生命科学的复杂系统和数据库越来越感兴趣。由此产生的生物学家与数学家、物理学家、计算机科学家和工程师的自然联盟导致了快速发展和高度跨学科的定量生物学领域的出现。这一新领域的重要性被联邦资助机构的一些新计划所强调，这些计划支持神经生物学、生物信息学/功能基因组学、动物行为、生态学和进化生理学等领域的跨学科、定量研究。

鉴于这些发展，俄亥俄大学于2000年12月成立了定量生物学研究所（QBI）。

使命及目标

定量生物学研究所的使命是刺激和集中跨学科的研究和培训工作在俄亥俄大学的定量生物学。我们的目标是：

  1. 促进生命科学家与数学、物理、计算机科学和工程等更多定量领域的研究人员之间的基础和应用研究合作

  2. 加强定量生物学的本科教育和研究机会

  3. 提供定量生物学的研究生教育和职业准备

  4. 在更大的社区中提高对定量生物学的认识和理解

研究

定量生物学研究所为跨学科研究合作提供了丰富的环境。该研究所研究任务的一个重要组成部分是促进生物学家和数学、物理、计算机科学和工程等传统定量领域的研究人员之间的研究合作。每一个单独的学科都有自己独特的思想史、文化和识别和解决感兴趣的问题的方法。这些学科之间的成功合作不仅需要个人学习新的方法，还需要学习对传统学科的新的思考方式。这些变化只能通过旨在培养跨学科视角的广泛互动来实现。该研究所通过各种正式和非正式的互动，为俄亥俄大学的这些跨学科互动提供了一个场所。

研究任务的一个关键组成部分是将我们的跨学科合作扩展到研究生和本科教育领域。这种研究与教育的结合不仅为学生提供了独特的培训机会，而且也符合一些资助机构的议程，这些机构将研究生和本科生的培训视为其研究使命的延伸。

研究生培训

定量生物学研究所为跨学科研究生本科教育提供了独特的机会。拥有物理学、数学或工程学本科学位的学生，如果想攻读生物学研究生，往往缺乏被普通生物系录取的生物学背景。拥有传统生物学学位的学生，如果想在数学、物理、计算机科学或工程领域正式追求更多的定量兴趣，也会面临类似的问题。

定量生物学研究所为这些学生提供了一个学术课程，使他们能够发展必要的跨学科专业知识。学生可以选择进入个别参与部门的研究生课程，或进入硕士或博士水平的个人跨学科课程（IIP）。进入IIP的学生可以根据自己的个人兴趣定制学习课程。

本科教育

该研究所负责定量生物学的本科生准备工作。这个级别的学生可以选择攻读双专业，例如生物、物理或计算机科学，或者通过两种机制中的一种来发展个性化的四年课程。

荣誉辅导学院提供了一个高度灵活的替代标准课程，用一对一的学生专业辅导代替讲课。本课程面向生物科学、计算机科学、工程物理、数学或物理专业的学生。

此外，大学学院提供专业研究学士学位课程，允许学生结合现有课程的元素，创建一个独特的和个性化的学习计划。

所有在俄亥俄大学接受定量生物学培训的学生都将获得大量的实践研究经验，作为他们教育的一部分。

教师

学院教师在生物科学、数学、物理和天文学等参与部门担任学术职务。

选择引用

  • “数学与生物2010连接本科学科”，LA Steen（编），美国数学协会，2005。

  • Cohen JE（2004）数学是生物学的下一个显微镜，甚至更好；生物学是数学的下一个物理，甚至比数学更好。生物科学进展2(12):439。

  • 《21世纪科学与数学教育导论》圣世纪生物学家”，W. Bialek和D. Botstein。科学303:788 - 790, 2004。
  • “未来科学家的培养”，宋国强等，《科学》第31期，2003。

  • 黑斯廷斯A， Arzberger P, Bolker B, Ives T， Johnson N等。（2003）21世纪的定量生物学。

  • 黑斯廷斯A，帕尔默MA（2003）生物学家和数学家的光明未来？科学299:2003 - 2004。

  • Palmer MA, Arzberger P, Cohen JE, Hastings A， Holt RD等人（2003）加速数学-生物联系。看看帕尔默实验室。

  • “应对跨学科生物科学的挑战”，J. McCarthy, Nature Reviews in Molecular Cell Biology，第5期，933-937,2004。
  • “数学在生物学中的应用与滥用”，《科学》，2004年第3期：790-793。
  • “理解生物复杂性：来自过去的教训”，JN Weiss et al.， FASEB杂志，17:1-6,2003。
  • “理解生物学中的复杂现象”，PK Maini，诺华基金会研讨会247:53-59；讨论60-65,84-90,244-252,2002。
  • 《生物信息学淘金热》，《科学美国人》2000年7月，第58-64页
  • 信息时代的生物信息学>，《科学》287:1221,2000年2月20日。
  • 《今日人类基因组商业》，《科学美国人》，2000年7月，第50-55页
  • 《美国大学在物理学和生物学之间架起桥梁》，《自然》397:3,1999年1月7日。
  • “生物信息学的繁荣”，《科学家》12(24):17,1998年12月7日。
  • “美国国立卫生研究院敦促资助中心合并计算和生物学，”科学284:1742,1999年6月11日。
  • “跨学科研究正在被扼杀”，《自然》396:202,1998年11月19日。
  • “简介：打破科学的玻璃天花板”（NSF新负责人Rita Colwell的简介和对生物复杂性的看法），《科学美国人》1998年12月第36页。
  • “人口生物学和生态系统科学中的数学和计算挑战”，《科学》275:334,1997年1月17日。
  • “生物学家戴上数学的眼镜”，《科学》274:2039,1996年12月20日。
  • 热点属性：计算的生物学家，《科学》272:1730,1996年6月21日。